RoHS檢測儀器，高效液相色譜儀是一種常用的分析方法，但不可能十全十美，作為使用者在掌握了高效液相色譜儀的特點，使用范圍和局限性的前提下，充分利用高效液相色譜儀的特點，就可在解決實際分析任務中發揮重要的作用。
高效液相色譜儀的應用
高效液相色譜儀適于分析高沸點不易揮發的、受熱不穩定易分解的、分子量大、不同極性的有機化合物；生物活性物質和多種天然產物；合成的和天然的高分子化合物等。它們涉及石油化工產品、食品、合成藥物、生物化工產品及環境污染物等，約占全部有機化合物的 80%。其余20%的有機化合物，包括永久性氣體，易揮發低沸點及中等分子量的化合物，只能用氣相色譜儀進行分析。
實驗室化驗檢測
高效液相色譜儀方法的局限性
一、在高效液相色譜儀中，使用多種溶劑作為流動相，當進行分析時所需成本高于氣相色譜儀。且易引起環境污染、當進行梯度洗脫操作時，它比氣相色譜儀的程序升溫操作復雜。
二、高效液相色譜儀中缺少如氣相色譜儀中使用的通用型檢測器（如熱導檢測器和氫火焰離子化檢測器）。近年來蒸發激光散射檢測器的應用日益增多，有望發展成為高效液相色譜儀的一種通用型檢測器。
三、高效液相色譜儀不能替代氣相色譜儀，去完成要求柱效高達10萬塊理論塔板數以上，必需用毛細管氣相色譜儀分析組成復雜的具有多種沸程的石油產品。
四、高效液相色譜儀也不能代替中、低壓柱色譜法，在 200kPa 至 1MPa 柱壓下去分析受壓易分解、變性的具有生物活性的生化樣品。